Taky mě v TB na Windows notifikace zlobí. Vypozoroval jsem, že když má účet filtry aby ihned po přijetí mail zařadil do jiné IMAP složky, tak se notifikace buď vůbec nezobrazí, nebo jen na malou chvíli. Vyřešil jsem to doplňkem MailBox Alert, který spouštím filtrem po přijetí jakéhokoliv mailu. K tomu existuje doprovodná aplikace, která umí zobrazit notifikaci.